Aquí se desarrolló una de la culturas más importantes del antiguo Perú, la cultura Tiahuanaco, máxima expresión del antiguo pueblo Aymara cuyos restos arqueológicos causan gran admiración.

Según la leyenda, el primer inca Manco Cápac y su compañera Mama Ocllo, emergieron de las profundidades del Lago Titicaca, enviados por su padre el Dios Sol para fundar el imperio del Tahuantinsuyo que fue dividido en cuatro regiones, ocupando Puno la región del Collasuyo que se extendía por la meseta del Collao, en lo que hoy es Perú y Bolivia.

Al llegar los españoles al Cuzco (a mediados del siglo XVI), se enteraron de la gran riqueza mineral de esta región, especialmente en oro y plata. Alrededor de 1660 las sangrientas luchas por la posesión de una rica mina en Laykakota, obligaron al Virrey Conde de Lemos a viajar a la zona con el fin de pacificarla, lo que produjo a la creación de la actual ciudad de Puno el 4 de Noviembre de 1668.